Το Φυσιοθεραπευτικό Κέντρο Κουντουριώτη είναι η εξέλιξη του Φυσικοθεραπευτηρίου που δημιούργησε το 1998, ο φυσιοθεραπευτής Δημήτρης Κουντουριώτης. Σκοπός του ήταν να προσφέρει φυσικοθεραπεία σε αυτούς που την είχαν ανάγκη.

Παρόλα αυτά, από τις πρώτες μέρες λειτουργίας του φυσικοθεραπευτηρίου, έγινε εμφανής η ανάγκη για την δημιουργία ενός εξειδικευμένου κέντρου με ικανό προσωπικό, για την αντιμετώπιση περιστατικών που να καλύπτει όλο το φάσμα ορθοπεδικών περιστατικών, από τα πιο απλά μέχρι τα πολύ περίπλοκα. Σύντομα το προσωπικό του φυσικοθεραπευτηρίου άρχισε να αυξάνεται, ως αποτέλεσμα του αυξανόμενου αριθμού πελατών και των απαιτήσεων τους στον τομέα υγείας. Η φιλοσοφία του φυσικοθεραπευτηρίου ήταν οι υπηρεσίες υψηλής ποιότητας, προσαρμοσμένες πάντα στις ατομικές ανάγκες του πελάτη. Η κέντρο ξεκίνησε να προσφέρει φυσικοθεραπευτική αποκατάσταση σε περιστατικά μετά από επανορθωτικές επεμβάσεις και μικροχειρουργική άκρας χείρας.

Το 2001, η Kountouriotis Medicare, ιδρύθηκε για να υποστηρίξει το κέντρο με την χρήση των στατικών και δυναμικών και άλλων ορθοπεδικών βοηθητικών που ήταν απαραίτητα για την αποκατάσταση των πελατών. Παρολαυτά, η κύρια ασχολία και το όραμα του Δημήτρη Κουντουριώτη ήταν και εξακολουθεί να είναι η παροχή υψηλών υπηρεσιών φυσικοθεραπείας ανάλογα με τις ανάγκες του κάθε πελάτη.

Όλα αυτά, είχαν ως αποτέλεσμα την αναβάθμιση της κλινικής σε Φυσιοθεραπευτικό Κέντρο Κουντουριώτη, το 2005. Στο μεταξύ, η κατασκευή του Κέντρου με βάση τα Ευρωπαϊκά Πρότυπα είχε αρχίσει και ολοκληρώθηκε τον Μάρτιο του 2006. Το νέο Φυσιοθεραπευτικό Κέντρο Κουντουριώτη άνοιξε τις πόρτες του στο κοινό, τον Απρίλιο του 2006.